弗布利氏綜合征兒童期或青春期起病，最早為6歲。可有反復發熱、出汗減少、四肢燒灼樣感覺異常、肢端疼痛和腎功能衰竭，甚至發生腦血管栓塞。皮損主要在下腹、大腿和陰囊部位出現小紅點，呈丘疹樣紫癜。神經系統癥狀較多，由于末梢神經、后根、脊髓后角病變而致四肢陣發性燒灼樣疼痛和感覺異常，自主神經系統受累而有陣發性腹痛、嘔吐、腹瀉、少汗、高熱；腦血管壁受累可引起偏癱、失語、抽搐等局灶性癥狀；垂體、丘腦下部受累可有內分泌異常。眼部癥狀也較多見，有視網膜血管及眼結合膜血管迂曲擴張、角膜混濁、眼瞼水腫，重者視力有影響。腎、心、肺、骨關節可出現相應癥狀。
腎臟表現
腎臟受累主要表現為高血壓、血尿、蛋白尿和脂肪尿，50%患者出現水腫。腎小管功能不全如濃縮稀釋、酸化功能等障礙是本病的早期表現。隨病情進展，30%患者在20～40歲最后進入終末期出現腎衰竭，此時腎臟體積變小。如腎血管病變比腎小球病變嚴重可并發腎梗死。腎臟病變是弗布利氏綜合征發病和死亡的首要原因。心血管病和腦血管病也是本病常見表現。腎臟病變最常表現為20～30歲間出現的隱匿輕微蛋白尿（0.5～2.0g/24h）。30～50歲常發展至尿毒癥伴高血壓，也有患者早在10～20歲發展至終末期腎臟病。一般腎病范圍的蛋白尿不常見。無蛋白尿的患者在偏振光顯微鏡下可見尿中馬耳他十字或在亮區顯微鏡下發現卵圓形的脂質體，提示存在脂質貯積病的可能。如在尿中發現髓磷脂體可確診法布里病。雜合子（女性）和半合子（男性）患者尿中神經鞘脂的含量比正常人多20～80倍。患者可有輕微的鏡下血尿。由于該疾病以X連鎖的隱性方式傳遞，半合子腎功能衰竭很常見。而雜合子也可發展至終末期腎臟病。
皮膚血管角質瘤
皮膚損害是本病的早期表現，可早至6～9歲時就出現，但多數發生在青春期，發病率約90%，平均發病年齡17歲。皮損為彌漫性血管角質瘤，即為散在性或成簇的圓形或卵圓形青紅色乃至黑色痣樣小丘疹，其大小為2～4mm不等。系皮膚血管的內皮細胞與平滑肌因鞘糖脂的沉積而弱化后擴張而來，有出血傾向，壓之不退色，較大皮疹可有過度角化。開始主要分布于陰囊、陰莖和大腿內側，以后可發生于臍周、骶部、肘、手指、髖兩側和口腔黏膜。出生時僅可見，以后可擴展成4mm，可高出表面，分布于臍膝之間的所謂“坐浴區”（軀干下部、臂、股、髖部及會陰處），常兩側對稱。隨年齡增長，角質瘤的數量與面積也增多增大。另一種皮損為分布于腋窩、上胸部和其他部位的毛細血管擴張。個別病例，四肢和胸部可出現結節性紅斑樣皮損，或出現眼眶、足部腫脹。皮膚損害常與疼痛發作同時發生，并有30～40歲后加重及淺表皮膚血管血栓形成傾向。血管角質瘤主要見于男性病人，但亦可見于少數雜合子女性病人。皮損通常不累及面部和眼。
自主神經系統功能失常
神經系統表現常是本病最早出現的癥狀，發病年齡在10歲，最初表現可發生在年僅5歲的小兒，可先于血管角質瘤多年前出現，故兒科醫師對此現象的認識十分必要。
血管角質瘤綜合綜合征神經系統受損的表現，主要是發作性痙攣掌痛（Fabrys危象）與四肢蟻爬感。Fabrys病患者痙攣掌痛與四肢蟻爬感典型表現是在冷熱、運動、勞動后，手掌和足底間歇發作性刺痛、燒灼痛，向四肢近端放射，嚴重的周期性發作持續數分鐘到數周。呈周期性發作疼痛者為77%，慢性病程者為89%，終身持續者為90%。也可表現為雷諾征、腹痛。隨年齡增長疼痛發作次數減少、程度減輕。誘發因素有發熱、天氣變暖、運動、緊張、飲酒。疼痛程度劇烈時，常伴有疲乏無力、發熱、出汗與血沉增快而誤為風濕。查體無神經系統體征。
此外，尚有37%患者有中樞神經系統損害癥狀，發病年齡一般大于26歲，表現為腦卒中（占24%），癡呆、被動和壓抑社會交往活動障礙等人格改變（占18%）。腦脊液檢查正常，腦部磁共振成像（MRI）檢查可早期發現白質和灰質小的病灶。
自主神經功能受損可以出現少汗或無汗、縮瞳、淚液與涎液減少、陽萎與直立性低血壓等，出現胃腸道癥狀者約有69%，表現為餐后發作性腹痛、腹瀉、惡心嘔吐，脂肪不能耐受等，多數患者明顯消瘦。
眼部病變
眼部體征是Fabrys病具有特征性變化之一。角膜混濁可見于所有的雜合子和大多數的半合子。患者可表現有晶狀體前部和后部的異常，出現白內障及視網膜血管迂曲、擴張，角膜混濁、角膜漩渦狀沉積物，盡管這不影響視力或視力輕度減退，特別是女性患者70%～80%可以僅表現出該病的眼部體征，當眼科醫師發現患者角膜變性或者晶狀體的改變時，應該想到Fabrys病，并建議患者去做基因檢查，以便發現該患者的其他家庭成員是否也患有此病。因此，眼科醫師在Fabrys病的診斷中應起著非常重要的作用。
心臟損害
心臟受損常常是Fabrys病患者的死因之一。主要表現為傳導障礙，心肌病，冠狀動脈功能不全或冠狀動脈阻塞導致心肌梗死，高血壓（腎臟缺血導致腎素分泌增加），瓣膜與升主動脈退行性病變（二尖瓣脫垂多見）。一般來講，Fabrys病患者溶酶體酶α-半乳糖苷酶A酶活性僅有正常人的1%～17%，如果殘余酶活性高，患者可以無癥狀或僅出現心臟的病變。當引起缺血性心臟病時患者可出現心絞痛、心肌梗死和充血性心力衰竭而死亡。
骨關節損害
骨骼變化少見，可出現關節運動受限。肘或腕關節運動受限可引起局部肌肉失用性萎縮。部分病例手指攣縮。急性發作期，多有關節及肌肉疼痛。
性腺發育不良
性欲和生殖力下降，這可能與睪丸受累有關。
其他系統器官
血管角質瘤綜合綜合征患者除以上臨床表現外，還可以見到進行性感覺神經性聽力喪失（78%）；面部出現水腫，嘴唇增厚，唇皺褶增多畸形（56%）；此外，部分患者可出現溶血性貧血、淋巴結病、肝脾腫大、骨無菌性壞死、肌病、肺功能減退、免疫功能低下，血小板聚集增強而易發生血栓與栓塞。