麻省理工的科學家們對目前最熱門的基因編輯系統CRISPR/Cas9進行了改造,這一成果發表在十二月十日的Nature雜志上。現在,人們可以用這一技術在活細胞中有效啟動任何基因。
這個系統可以讓科學家們更簡便地研究不同基因的功能,領導這項研究的CRISPR技術先驅張鋒(Feng Zhang)說。
改造后的CRISPR技術,可以快速對整個基因組進行功能篩選,幫助人們鑒定涉及特定疾病的基因。張鋒等人在這項研究中就鑒定了讓黑色素瘤細胞抵抗癌癥藥物的幾個基因。
CRISPR原本是細菌抵御病毒感染的免疫體系。之前人們利用這個系統建立了基因編輯復合體,這個復合體包括Cas9酶和引導RNA。引導RNA結合到基因組的特定序列,告訴Cas9在哪里進行剪切。
近兩年來,Cas9工具被廣泛用于關閉或替換基因,而張鋒等人這次成功將它改造來啟動基因。
之前也有人嘗試過用CRISPR系統啟動基因。他們失活了Cas9的剪切活性,并將Cas9連上活化結構域,這些結構域能夠招募轉錄機器,啟動轉錄過程。然而這些努力并不能持續啟動基因轉錄。
張鋒等人之前曾經獲得了Cas9結合引導RNA和目標DNA時的結構,他們決定在此基礎上對CRISPR-Cas9進行改造。“知道了它的3D形態,我們就能合理的改善這個系統,”張鋒說。
人們過去是將活化結構域連接在Cas9的末端,但效果并不理想。MIT這個團隊意識到,RNA從Cas9復合體伸出的兩個小環是更好的連接位點,這樣活化結構域在招募轉錄機器時就更加靈活。他們用改造后的CRISPR系統成功激活了十個基因。這些基因的轉錄都得到了兩倍以上的增漲,許多基因的活性甚至有了幾個數量級的增加。
隨后,研究人員建立了70,290個引導RNA的文庫,來靶標人類基因組超過兩萬個基因。他們由此鑒定了讓黑色素瘤抵抗藥物PLX-4720的基因。PLX-4720對于攜帶BRAF突變的患者療效比較好,殘存下來的癌細胞會長成新的腫瘤,導致癌癥復發。
研究人員將CRISPR元件引入大量體外培養的黑色素瘤細胞,不同細胞對應靶標不同基因的引導RNA。然后他們用PLX-4720處理這些細胞,由此鑒定幫助癌細胞生存的基因。事實上他們也的確發現了幾個新的抗性基因。這樣的研究可以幫助人們開發新的癌癥藥物,阻止腫瘤獲得抗性。
下一步張鋒實驗室計劃繼續進行篩選,尋找那些激活時能校正自閉癥或神經退行性疾病(比如阿爾茨海默癥)的基因。
據中山大學消息,23日,中山大學錢軍教授團隊聯合廣州醫科大學附屬市八醫院劉林娜教授團隊、吉林大學第一醫院劉全教授團隊以及中山大學楊建榮教授團隊在《細胞》(Cell)雜志發表論文,首次系統揭示了埃博拉病......
近日,一項發表于《分子精神病學》的研究發現,單個基因GRIN2A可直接導致精神疾病。而此前的研究認為,精神疾病是由許多基因共同作用所致。根據世界衛生組織(WHO)數據,2021年全球每7人中就有1人患......
三維基因組互作與表觀遺傳修飾是基因表達調控的重要因素,其動態變化與細胞生長發育及癌癥等疾病的發生發展密切相關。解析染色質在活細胞內的時空動態,是理解基因調控機制的重要科學問題。現有基于CRISPR-C......
11月1日,在長沙舉行的第五屆湖南省抗癌協會家族遺傳性腫瘤專業委員會學術年會上,中信湘雅生殖與遺傳專科醫院(下稱中信湘雅)首席科學家盧光琇宣布,該院第100位通過胚胎植入前遺傳學檢測(PGT)技術阻斷......
近日,南京大學教授曹毅、四川大學教授魏強以及合作者在《自然-通訊》上發表研究成果。研究深入探討了動態剛度增強細胞力所帶來的功能性影響,發現快速循環剛度變化能讓細胞在原本無法移動的軟基底上實現高速遷移。......
10月16日,記者從中信湘雅生殖與遺傳專科醫院獲悉,該院研究員林戈、副研究員鄭偉團隊,聯合山東大學、上海交通大學醫學院等單位的科研團隊開展合作攻關,系統揭示了卵子與早期胚胎質量問題導致女性反復“試管”......
衰老對身體產生的可見影響有時與基因活動的無形變化有關。DNA甲基化的表觀遺傳過程會隨著年齡增長而變得不再精確,造成基因表達的變化。而這種變化與隨著年齡增長而出現的器官功能衰退和疾病易感性增加有關。如今......
有些人比同齡人更顯年輕,而有些人看著更顯老;有些人年逾九旬仍身心康健,而另一些人早在數十年前就飽受糖尿病、阿爾茨海默病或行動障礙的困擾;有些人能輕松應對嚴重摔傷或流感侵襲,而有些人一旦住院就再難康復。......
近日,西北農林科技大學玉米生物學與遺傳育種團隊聯合華中農業大學玉米團隊在《植物生理學研究》發表論文。研究初步揭示了ZmGBF1-ZmATG8c模塊通過自噬途徑調控玉米耐熱性的分子機制。隨著全球氣溫持續......
如何精確指揮細胞執行特定任務,是合成生物學發展的關鍵挑戰。7月31日,中國科學院深圳先進技術研究院研究員陳業團隊聯合湖南省農業科學院單楊團隊在《自然-通訊》發表最新研究。他們建立了一套全新的生物信號處......