鑒別診斷
（一）常見疾病鑒別
1.腰骶關節勞損
慢性腰骶關節勞損為持續性、彌漫性腰痛，以腰骶部最重，脊椎活動不受限，X線無特殊改變。急性腰骶關節勞損，疼痛因活動而加重，休息后可緩解。
2.骨關節炎
常發生于老年人，特征為骨骼及軟骨變性、肥厚，滑膜增厚，受損關節以負重的脊柱和膝關節等較常見。累及脊椎者常以慢性腰背痛為主要癥狀，與AS易混淆。但本病不發生關節強直及肌肉萎縮，無全身癥狀，X線表現為骨贅生成和椎間隙變窄。
3.Forestier病（老年性關節強直性骨肥厚）
脊椎亦發生連續性骨贅，類似AS的脊椎竹節樣變，但骶髂關節正常，椎間小關節不受侵犯。
4.結核性脊椎炎
臨床癥狀如脊椎疼痛、壓痛、僵硬、肌肉萎縮、駝背畸形、發熱、血沉快等與AS相似，但X線檢查可資鑒別。結核性脊柱炎時，脊椎邊緣模糊不清，椎間隙變窄，前楔形變，無韌帶鈣化，有時有脊椎旁結核膿瘍陰影存在，骶髂關節為單側受累。
5.類風濕關節炎
現已確認AS不是RA的一種特殊類型，兩者有許多不同點可資鑒別。RA女性多見，通常先侵犯手足小關節，且呈雙側對稱性，骶髂關節一般不受累，如侵犯脊柱，多只侵犯頸椎，且無椎旁韌帶鈣化，有類風濕皮下結節，血清RF常陽性，HLA-B27抗原常陰性。
6.腸病性關節病
潰瘍性結腸炎、Crohn病或腸原性脂肪代謝障礙（Whipple）都可發生脊柱炎，且腸病性關節病受累關節和X線改變與AS相似而不易區別，因此需要尋找腸道癥狀和體征，以資鑒別。潰瘍性結腸炎有結腸黏膜潰瘍、水腫及血性腹瀉。Crohn病有腹痛、營養障礙及瘺管形成。Whipple病有脂肪瀉，急劇消瘦等。這些都有助于原發性疾病的診斷。腸病性關節病HLA-B27陽性率低，Crohn病病人腸灌注液IgG增高，而AS病人腸灌液中IgG基本正常。
7.Reiter綜合征和銀屑病關節炎
兩病均可發生脊柱炎和骶髂關節炎，但脊柱炎一般發生較晚，較輕，椎旁組織鈣化少，韌帶骨贅以非邊緣型為主（纖維環外纖維組織鈣化），在相鄰兩椎體間形成部分性骨橋與AS的竹節樣脊柱不同。骶髂關節炎一般為單側性或雙側非對稱損害，牛皮癬關節炎則有皮膚銀屑病損害等可資鑒別。
8.腫瘤
腫瘤亦可引起進行性疼痛，需作全面檢查，明確診斷，以免誤診。
9.急性粉絲熱
部分病人初期臨床表現頗似急性粉絲熱，或出現大關節腫痛，或伴有長期低熱、體重減輕，以高熱和外周關節急性炎癥為首發癥狀的也不少見，此類病人多見于青少年，也容易被長期誤診。
10.結核病
個別病人初期類似結核病，表現為低熱、盜汗、虛弱、乏力、體重減輕、貧血，有時伴有單側髖關節炎癥，易被誤診為結核病。有關的結核檢查可鑒別。
（二）與血清陰性脊柱關節病鑒別
1.Reiter綜合征和銀屑病關節炎
可發生脊柱炎和骶髂關節炎，但脊柱炎一般發生較晚，較輕，椎旁組織鈣化少，韌帶骨贅以非邊緣型為主（纖維環外纖維組織鈣化），在相鄰兩椎體間形成部分性骨橋與強直性脊柱炎的竹節樣脊柱不同。骶髂關節炎一般為單側性或雙側非對稱性，棘突關節病變少見，無普遍性骨質疏松。另外，Reiter綜合征有結膜炎、尿道炎、黏膜皮膚損害，銀屑病關節炎則有皮膚銀屑病損害等可供鑒別。
2.腸病性關節炎
潰瘍性結腸炎、Crohn病、腸原性脂肪代謝障礙（Whippe）都可發生脊柱炎，且腸病性關節病受累關節和X線改變與強直性脊柱炎相似而不易區別，因此需要尋找腸道癥狀和體征，以資鑒別。潰瘍性結腸炎有結腸黏膜潰瘍、水腫及血性腹瀉，Crohn病有腹痛、營養障礙及痿管形成，Whipple病有脂肪瀉，急劇消瘦等。腸病性關節病HLA-B27陽性率低，Crohn病病人腸灌注液IgG增高，而強直性脊柱炎病人腸灌液中IgG基本正常。
3.反應性關節炎
常繼發于身體其他部位感染后出現，一般可以發現感染灶，抗生素有效。