影響高速逆流色譜的因素
1.固定相的保留值
在逆流色譜中，留在管中固定相的量是影響溶質峰分離度的一個重要因素，高保留量將會大大改進峰分離度。
儀器對保留值的影響（外因） 研究表明：螺旋管支持件的自轉半徑r與公轉半徑R之比B值是一個影響兩相互不混溶溶劑在旋轉螺旋管內保留的關鍵因素。用大直徑的支持件使值進一步提高，能導致親水性溶劑體系的單向性流體動力學分布反向；反之，用小直徑的支持件使值減小，能使疏水性溶劑體系的單向性流體運動方向反向，而介于疏水性和親水性溶劑之間的中間極性溶劑，其兩相分布狀況則會受到離心力條件的影響。
溶劑體系物理因素對保留值的影響（內因）
溶劑體系的物理因素如溶劑的黏度對固定相的保留影響很大，低黏度的溶劑體系可望得到高的固定相保留，界面張力和兩相間的密度差會對溶劑在臨界點附近的分層時間產生較大的影響，一般為保證固定相保留值合適，溶劑體系的分層時小于30s。
2. 轉速的影響
螺旋管的旋轉速度對兩相溶劑在流體動力學平衡時的體積比，也就是對固定相的保留值的影響很大，從而影響了分離效果。當然，并不是轉速越快越好，一般對于分配得不是太好的溶劑體系，如兩相體系帶有氯仿的，還要固定相分層比較慢的兩相體系，通常情況下轉速越高，越易產生乳化現象。
3. 流速的影響
流動相流速也會影響兩相的分布，一般情況下，流動相流速越大，固定相流失加重，但流速過慢會導致分離時間過長，從而造成對溶劑的浪費。
4.溫度的影響
溫度的提高溶劑的黏度有很大的影響，一般提高溫度會獲得高的保留值，而相反降低溫度則得到低的保留值，但一般溫度不可能提高太多，因為所用的都是有機溶劑，沸點很低。
5. 相聯檢測技術
可見光檢測、紫外光檢測技術在HSCCC中應用較多。但有時由于組分對可見光或紫外光無吸收，或是固定相的流失導致流出液乳化，故無法用常用光學檢測器檢測。現己出現了HSCCC與質譜（MS）、電子電離質譜（EI-MS）、化學電離質譜（CI-MS）快速原子轟擊質譜（FAB-MS）、熱噴霧質譜（TSP-MS）和電噴霧質譜（ESI-MS）的聯用。