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  • 發布時間:2022-03-25 10:07 原文鏈接: 怎樣設計引物

    一般是通過設計軟件,例如oligo6,primer5等,你可以在網上搜一下引物設計軟件下載和使用說明,是比較容易的。
    至于設計引物的一般原則如下:
    * 序列選取應在基因的保守區段
    * 避免引物自身或與引物之間形成4個或4個以上連續配對,避免引物自身形成環狀發卡結構
    * 典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長,保證序列獨特性,并降低序列存在于非目的序列位點的可能性。但是長度大于24核苷的引物并不意味著更高的特異性。較長的序列可能會與錯誤配對序列雜交,降低了特異性,而且比短序列雜交慢,從而降低了產量。
    * Tm值在55-65℃(因為60℃核酸外切酶活性最高),GC含量在40%-60%
    * 引物之間的TM相差避免超過2℃
    * 引物的3’端避免使用堿基A,引物的3’端避免出現3個或3個以上連續相同的堿基
    * 為避免的擴增,引物設計最好能跨兩個外顯子。
    * Taqman探針PCR要求片段長度在80bp-150bp
    * 引物末端(最后5個核苷酸)不能有超過2個的G和C。

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