對流感病毒肺炎的預防，應先預防流感，掌握國內外疫情和病毒變異動態，人群免疫力狀態，有利于疫情偵察，以便及時采取預防措施，加強衛生宣傳教育，力爭做到五早，即早發現、早診斷、早報告、早隔離、早治療，同時盡力減少傳播的機會，在流感流行期間，避免進入人員擁擠場所，患者的鼻咽分泌物及其污染物應隨時消毒，可應用疫苗作預防注射，疫苗多以甲型為主，但流感病毒不斷發生變異，可及時選用弱毒株制備疫苗。
在流行前1、2個月內接種較好，接種后有較輕微的呼吸道癥狀，個別有發熱，有效保護時間為6個月至1年，多數觀察者證明可降低發病率50%～70%，一般情況下嬰幼兒和老弱者不宜接種，至于藥物預防方法，如金剛烷胺鹽酸鹽因其能阻止流感病毒進入人體細胞內，故有一定預防作用，中草藥預防流感方面，可試用多種單方和復方中草藥，已取得了不少經驗，值得進一步研究觀察。
