慢性甲狀腺炎尚無良好的治療方案,因此往往較難于阻止其發展變化,部分已做手術患者,其病情仍可有發展與纖維化,往往因呼吸困難,廣泛纖維化而窒息死亡疾病后期因可伴發纖維性膽道炎,腹膜后纖維化肺纖維化,縱隔纖維化等而導致多系統功能減退與衰竭因此,慢性甲狀腺炎屬于難治愈性疾病,預后多不佳,應對患者長期追蹤觀察,并繼續深入研究。