1、乙肝病毒的免疫耐受階段，主要特點是沒有任何癥狀或者癥狀比較輕微，乙肝病毒復制活躍，轉氨酶水平相對正常或者有輕度的升高，肝組織學沒有明顯的異常，這一階段圍生期感染的患者比較多見，此時是不需要進行乙肝的抗病毒治療的。
2、乙肝病毒的免疫清除階段，主要表現為乙肝病毒脫氧核糖核酸的滴度相對增加，轉氨酶升高，肝組織壞死有炎癥等表現，這一階段是抗病毒治療有較好療效的階段。
3、乙肝病毒的非活躍復制階段，主要表現為肝炎壞死癥狀得到緩解，轉氨酶水平恢復正常，病毒復制不活躍，這一狀態可持續終生，但是有部分患者反復出現HBVDNA復制，出現HBVDNA滴度升高或者轉氨酶升高的現象，且有進展為肝硬化的可能，因此對于此類患者仍然需要進行乙肝的抗病毒治療。