1、檢驗 血尿常規。大便常規及培養，1/d，3次，停藥后再2次。并作藥敏試驗。必要時以PCR法查大便志賀菌。大便鏡檢注意原蟲(阿米巴原蟲、隱孢子蟲)、腸滴蟲、各種寄生蟲蟲卵、霉菌菌絲。各種腸毒素測定。如大腸埃希菌腸毒素(LT、ST)，難辨梭狀芽胞桿菌毒素。厭氧菌培養(空腸彎曲菌、難辨梭菌)。電鏡查病毒顆粒、核酸電泳圖譜(PAGE)。
2、特殊檢查 注意有無脫水酸中毒，并評估脫水酸中毒程度。抽血查鉀、鈉、氯、HC0-3含量。
3、鑒別診斷 凡未得到病原學診斷者，確診時均需與其他感染性腹瀉及非感染性腹瀉鑒別。