慢性結腸炎的主要癥狀包括腹瀉、腹痛、腹脹和可能的慢性便秘。 患者可能會經歷大便次數的不規律性，有時便秘與腹瀉交替出現。腹痛可能在排便前出現，也可能伴隨整個病程。此外，患者可能伴有惡心、腹脹、食欲不振等消化系統癥狀。在急性發作期，還可能出現高熱、腹部絞痛、惡心嘔吐、大便急迫如水或粘凍血便等表現。
