慢性腎功能衰竭影響到各個系統和器官，可引起多種多樣的臨床表現，但是，在80%的腎單位喪失以前，或當GFP下降到25ml/分鐘以前，可以沒有任何癥狀或只有很少的生化改變，在諸如多囊腎等慢性進行性疾病中，即使GFR低于10ml/分鐘，也可以沒有癥狀，這是由于殘存腎單位巨大的適應作用所致。慢性腎功能衰竭晚期主要引起如下多種臨床病變：
1.水，電解質，酸堿平衡紊亂
腎臟的基本功能即調節水，電解質，酸堿平衡，腎功能不全時，由于其排泄或代謝功能障礙，必然會引起不同程度的水，電解質，酸堿平衡紊亂，然而，同ARF不一樣，CRF在其漫長的病程中由于機體各種代償機制，這些代謝紊亂有時顯得并不十分明顯，事實上，在輕中度CRF時，喪失部分功能的腎臟仍然較完全地排出各種外源性攝入和體內產生的物質或廢物，當正常的腎功能喪失約70%時，一般只會出現部分水，電解質，酸堿平衡紊亂，只有當腎功能進一步下降，以及攝入或體內產生過多的水，電解質，酸性或堿性物質才會出現明顯的臨床表現。
2.糖，脂肪，蛋白質和氨基酸代謝障礙。
3.各系統功能障礙
①消化系統；②心血管系統；③呼吸系統；④神經系統；⑤血液系統；⑥運動系統；⑦皮膚變化；⑧免疫系統；⑨內分泌系統，均發生不同程度的障礙。