繼發性腹膜炎絕大多數需要手術治療。
1、手術適應癥：
①經上述非手術治療6~8小時后（一般不超過12小時），腹膜炎癥及體征不緩解反而加重者；
②腹腔內原發病嚴重，如胃腸道或膽囊壞死穿孔、較窄性腸梗阻、腹腔內臟器損傷破裂，胃腸手術后短期內吻合口漏所致的腹膜炎；
③腹腔內炎癥較重，有大量積液，出現嚴重的腸麻痹或中毒癥狀，尤其是有休克表現者；
④腹膜炎病因不明，無局限趨勢者。
2、手術處理原則：
①明確病因，處理原發病如縫合胃腸之穿孔，切除壞疽穿孔的闌尾、膽囊等病灶；
②徹底清理腹腔，吸凈腹腔內的膿液及液體，清除食物殘渣、糞便、異物等，可用甲硝唑及生理鹽水灌洗腹腔至清潔，關腹前是否應有抗生素，尚有爭議
③充分引流，防止發生腹腔膿腫，嚴重的感染要放兩條以上引流管，并可做腹腔沖洗。
3、術后處理：禁食、胃腸減壓、補液、應用抗生素和營養支持治療，保證引流管通暢。
4、手術方式的選擇。在急性腹膜炎的手術方式選擇上，除傳統的剖腹探查術之外，還可以選擇腹腔鏡探查術。腹腔鏡具有清洗腹腔徹底、創傷小、恢復快、并發癥少等優點，不但能明確診斷，避免因診斷不明而導致的病情延誤，而且還可以指導開腹切口的選擇或完成一些外科治療，對于部分急性腹膜炎病人是一個安全有效的選擇。