由于兒童過敏性鼻炎哮喘綜合癥為過敏性疾病，一旦確診就應該盡早給予抗變態反應藥物。有效地控制過敏性鼻炎可以避免大多數哮喘發作或避免哮喘加重，因此使用抗變態反應藥物治療過敏性鼻炎對改善哮喘病的預后具有重要意義。抗變態反應藥物的普通劑量即可有效治療過敏性鼻炎來預防哮喘發作，加倍劑量可改善并發的哮喘癥狀。給予抗變態反應藥加偽麻黃堿治療小兒過敏性鼻炎哮喘綜合癥在改善鼻塞癥狀的同時，更可改善哮喘癥狀、提高PEF和減少支氣管擴張劑的用量。在兒童，上呼吸道感染和哮喘加重能被連續的抗組胺藥治療所控制。在過敏性體質兒童早期治療(Early Treatment of the Atopic Child ETAC)的研究中發現，抗變態反應藥物的連續應用可降低哮喘的發病率。