男嬰多于女嬰，以散發病例為主，無明顯季節性，出生后胎糞正常，常在生后2～3周內發病，以2～10天為高峰，在新生兒腹瀉流行時NEC也可呈小流行，流行時無性別，年齡和季節的差別。
1.腹脹和腸鳴音減弱
患兒先有胃排空延遲，胃潴留，隨后出現腹脹，輕者僅有腹脹，嚴重病例癥狀迅速加重，腹脹如鼓，腸鳴音減弱，甚至消失，早產兒NEC腹脹不典型，腹脹和腸鳴音減弱是NEC較早出現的癥狀，對高危患兒要隨時觀察腹脹和腸鳴音次數的變化。
2.嘔吐
患兒常出現嘔吐，嘔吐物可呈咖啡樣或帶膽汁，部分患兒無嘔吐，但胃內可抽出含咖啡或膽汁樣胃內容物。
3.腹瀉和血便
開始時為水樣便，每天5～6次至10余次不等，1～2天后為血樣便，可為鮮血，果醬樣或黑便，有些病例可無腹瀉和肉眼血便，僅有大便隱血陽性。
4.全身癥狀
NEC患兒常有反應差、神萎、拒食，嚴重者面色蒼白或青灰、四肢厥冷、休克、酸中毒、黃疸加重，早產兒易發生反復呼吸暫停、心律減慢、體溫正常或有低熱，或體溫不升。