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1. 提供含收集培養基的容器，標注明確，送進手術準備室或病理實驗室。
2. 做好準備，隨時取材。
3. 手術后裝入收集容器，或派人收集后迅速送達，并告知確切的切取時間。
4.
將樣本送入培養室，樣本應包裹三層（由內向外為：密封管、密封的塑料袋與內襯紗布墊的袋子，上面標明姓名、地址及電話號碼，帶防漏蓋子、裝有半管含抗生素培養基）。雖然儲存時間越長，組織破壞越嚴重，但通常活檢組織在
4°C 下可存活至少 24 h ，甚至 3~4 天。
5. 將樣品的數據記錄在手寫筆記本中以備轉入計算機數據庫，或直接輸人數據庫。
6. 去除污染
雖然大多數手術標本取材時是無菌的，但在隨后的處理中可能會產生問題。表皮組織（如皮膚、黑色素瘤）和胃腸道標本特別容易污染，即使皮膚活檢前經過除菌清洗、腸道手術前用過非腸道抗生素。可以向醫學微生物學家咨詢在組織中可能存在的菌群，根據需要選擇抗生素用于收集及解離標本。若手術標本很大（即
200 mg 或再大），可置 70 % 乙醇中短暫浸泡 （30 s~1 min ）， 將有助于減少表面感染并避免損傷深部組織。
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