本方法通過SDS裂解細胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分
一：儀器：同方法一
二：試劑：TE、TAE緩沖液；10%SDS；５ＭNaCL；
20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，緩慢加入10gCTAB，加熱溶解)；25/24/1,酚/氯仿/異戊醇; 24/1,氯仿/異戊醇；異丙醇；７０％及100%乙醇
三：操作
1.5ml 對數生長期細菌細胞
離心，5000rpm,1min
沉淀
溶于500μl TE緩沖液中混勻
30μl 10%SDS,3μL蛋白酶Ｋ，混勻，37℃,1小時
100μl NaCL(5M) 混勻
80μl的CTAB/NaCL,*混勻；65℃ 10min（可不做）
加入等體積酚/氯仿/異戊醇混合液，混勻，
離心12000rpm,4-5min
取上清，以下操作與方法一中有機溶劑抽提、沉淀、干燥、除RNA 、復溶等步驟一致。
注意 １，*此步操作后，離心管中NaCL的濃度不應低于0.5M，否則DNA將與CTAB共沉淀。
2,本法適用于從多糖含量高的樣品中提取DNA。對于菌體樣品,通過此流程,可以獲得較為完整的DNA分子。