目前還有很多人對智能種子發芽室的用途會存在不小的疑問，同時對于利用智能種子發芽室種子發芽實驗目的也存在一定的疑慮，而實際上簡單點來說，利用智能種子發芽室進行種子發芽實驗目的是就是探明種子發芽所需的溫度、濕度、光照度等，從而通過智能環境調控，就能使種子發芽幾率得到提高，提高種子的發芽率。
不難理解，不同的種子所需要的環境因子是不相同的，比如大豆種子和玉米種子相比，它們在發芽的過程中需要的水分和陽光是不同的，如果不清楚它們的需求情況，而根據經驗進行發芽試驗的話，那么種子的發芽率肯定是得不到保證的，而使用智能種子發芽室可以對這些環境因子進行精準控制，從而為其提供做合適的發芽環境，從而提高種子的發芽率。
在育種領域，種子發芽實驗是其中非常重要的試驗項目，也是種子檢驗中四項強制性質量指標中最重要的指標之一，對于探究植物生理等方面，有非常重要的意義。而實際上由于以前缺乏像智能種子發芽室這樣的環境控制設備，導致種子發芽實驗的開展，遇到了不小的阻力，嚴重影響了育種項目的進度和成果。因此，隨著科技的發展，和種子研究的深入，種子實驗室中開始廣泛采用智能種子發芽室，通過它為種子發芽創造了綠色健康的生長環境，大大提高了種子的發芽概率，為種子的研究做出了重要的貢獻。
智能種子發芽室很好的模擬了種子發芽需要的外部自然環境。在該設備里，可以人工控制溫度、濕度、風速、光照等，大大提高了種子的發芽率。目前，利用智能種子發芽室進行種子發芽實驗已經成為保障種子發芽試驗結果的準確性、可靠性、可重復性的重要途徑，是現代育種工作中的重要技術應用。
