所謂智能考種系統，就是能通過軟件自動計算種子粒數、面積、周長、長度、寬度、長寬比等數據的智能系統，它的應用讓人們摒棄了傳統考種的復雜流程，讓考種變得更加方科學、方便。
就以油菜考種來說，油菜產量由單株角果數、每角果粒數、種子千粒重三因素構成。這些因素是室內考種的基本項目，其考測結果的準確如何，將直接影響試驗結果的正確反映。關于每果粒數的考測方法，過去采用“取樣法”，即在植株上摘取一定的角果數，求其平均粒數，以代表該株每果粒數。而在長期的工作中我們發現，這種方式準確性較差，效率很慢。比如過去要測量在種子的千粒重，需要用曬干的純凈種子，隨機取樣三份，分別稱重取差異不超過3%的平均值，以克表示。現在只需要借助智能考種系統數出一千粒種子，再用電子天平稱重即可。
此外，考種還是測產和研究品種性狀的必要項目。從中，我們也可以研究出油菜氮磷鉀肥效應。在氮、鉀、硼肥平衡施用下可以顯著提高油菜的生物性狀。利用智能考種系統測量發現：施用氮肥能明顯增加油菜角果總數和提高油菜籽粒產量，同時可以顯著提高籽粒和莖稈比值；施用磷肥可以顯著提高單株一級分枝數、單株二級分枝數，同時顯著提高籽粒產量，明顯提高籽粒/莖稈比值；施用鉀肥可以顯著增加單株角果數，提高產量，同時提高籽粒/莖稈的比值；相比當地農民習慣施肥可以顯著提高單株角果數量，顯著增加產量，同時提高籽粒和莖稈比值。