最常見的模式生物有:逆轉錄病毒(retrovirus),大腸桿菌(Escherichiacoli),酵母(buddingyeast(Saccharomycescerevisiae),fissionyeast(Schizosaccharomyces pombe)),秀麗線蟲(Caenorhabditis elegans),果蠅(Drosophila melanogaster),斑馬魚(Danio rerio),小鼠(Musmusculus)等,
此外模式植物包括:擬南芥(Arabidopsis thaliana),水稻(Rice(OryzasativaL.))等。