有機化合物的熒光分析應用很廣泛,能測定的有機物質有數百種之多,如酶和輔酶的熒光分析,農藥和毒藥的熒光分析,氨基酸和蛋白質的熒光分析,核酸的熒光分析。這些構成了熒光分析技術的主要內容。
許多有機化合物在紫外線的照射下,所發熒光并不強或不發熒光,因此必須使用某些有機試劑,以便生成的產物在紫外線照射下能發射強的熒光。例如脂肪族有機化合物就是用間接方法測定的。