催化來自糖酵解或其它異化反應的乙酰CoA與草酰乙酸縮合合成檸檬酸反應的酶。因為由乙酰CoA游離出CoA是放能反應（ΔG0′=-7.7千卡），以致平衡趨于生成檸檬酸的方向。
此酶控制三羧酸循環的入口，受到多種調控。它是變構酶，受NADH、 ATP和α-酮戊二酸別構抑制，琥珀酰輔酶A與乙酰輔酶A競爭抑制，AMP可對抗ATP的抑制，起激活作用。
在肝臟和其它組織中成為三羧酸循環的限速步驟，存在于線粒體基質（mit-ochondrial matrix）中。
