1．為DNA的復制提供支架，DNA是以復制環的形式錨定在核骨架上的，核骨架上有DNA復制所需要的酶，如：DNA聚合酶α、DNA引物酶、DNA拓樸異構酶II等。DNA的自主復制序列（ARS）也是結合在核骨架上。
2．是基因轉錄加工的場所，RNA的轉錄同樣需要DNA錨定在核骨架上才能進行，核骨架上有RNA聚合酶的結合位點，使之固定于核骨架上，RNA的合成是在核骨架上進行的。新合成的RNA也結合在核骨架上，并在這里進行加工和修飾。
3．與染色體構建有關，現在一般認為核骨架與染色體骨架為同一類物質，30nm的染色質纖維就是結合在核骨架上，形成放射環狀的結構，在分裂期進一步包裝成光學顯微鏡下可見的染色體。