磁體主要有主磁體（產生強大的靜磁場）、補償線圈（校正線圈）、射頻線圈和梯度線圈組成。
主磁體用以提供強大的靜磁場，而且要求較大的空間范圍（能容納病人），保持高度均勻的磁場強度。衡量磁體的性能有四條標準：磁場強度、時間穩定性、均勻性、孔道尺寸。增加靜磁場強度可使檢測靈敏度提高，即掃描時間縮短和空間分辨率提高。但也會使射頻場的穿透深度減少。磁場強度為0.35T時，可以得到很好的空間分辨率，當前臨床上所用的較高的磁場強度為1.5T。
