核糖體DNA（Ribosomal DNA，rDNA）是一種DNA序列，該序列用于rRNA編碼。核糖體是蛋白質和rRNA分子的組合，翻譯mRNA分子以產生蛋白質的組件。
真核生物的rDNA包括一個單元段，一個操縱子，以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束組成的串聯重復序列。rDNA還有另一個基因，由SrRNA基因編碼，位于大多數真核生物的基因組中。S rDNA序列也存在于果蠅的串聯重復序列。
