生化研究，測定核酸的結構
· RNase 保護檢測
· 去除非特異結合的RNA
· 分析RNA 序列
· 水解蛋白樣品中的RNA
· 純化DNA
此外，它具有顯著的細胞毒性，可以殺滅許多腫瘤細胞系，可以抑制導致艾滋病的HIV-1病毒在細胞中的復制，可以治療乙肝。
(1)從DNA-RNA或RNA—RNA雜合體中去除未雜合的RNA區。
(2)確定DNA或RNA中單堿基突變的位置(Myers et al．1985，Winter et al．1985)。 在此方法中，RNA-DNA或RNA-RNA雜合體上的單堿基錯配可被RNA酶A識別并切割。利用含SP5或T7噬菌體啟動子的質粒，在體外合成與野生型DNA或RNA互補的32p標記RNA探針，然后與待檢含單堿基置換的DNA或RNA退火， 所產生的單堿基錯配可用RNA酶A切割，通過凝膠電泳分析切割產物的大小即可確定錯配的位置。在所有各種可能的單堿基錯配中，大約50%可用此法確定。