要回答這個問題要確定你是在哪一步發現降解了。
是在質粒提取后后，直接點樣發現降解的話，可能是提取過程中大腸桿菌富含DNase，或是操作過程中堿裂解過長
如果是在酶切過程中降解了，可能有鹽離子污染導致特異性酶變成非特異性酶了，把質粒都降解了。
如果是在保存一段時間發現降解了，可能是保存液不是TE或是質粒發生了降解。具體要分析一下
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