苔蘚植物的生態學特征不同于高等植物，所以對于它們的生理生態研究是十分重要的。對于 苔蘚植物的配子體體積、枝直根、枝條長度、分枝數、枝尖數(芽體等)等性狀會隨著環境條件的變化而發生一定程度的變化，但是傳統的方法無法定量地獲得這些 性狀的數據.近年來對于植物根系的測定一般可以采用根系分析系統進行測定，也為研究苔蘚植物的遺傳性穩定性作出了很大的貢獻。
WinRHIZO是一套專業的根系分析系統軟件，在獲得掃描圖像后通過該軟件能夠快速簡便地獲得根系總長度、投影面積、表面積、平均直徑、總體積、根尖數、根的分叉數、根系交疊數等指標少-泛運用十根系形態和構造研究.側葫鮮類植物呈甸旬狀，其整體形態、分枝特點等類似十被子植物中的根系.根系的形態特點可以用總長度、分枝數、突出數、投影面積、表 面積、直徑、體積等參數進行描述，而側葫鮮類的配子體枝條總長度、分枝數、表面積、枝(帶葉)莖和枝的直徑等與根須的有很強的對應性。
人們通過環境條件模擬發現借助根系分析系統，通過對不同環境條件下同一類群配子體形態參數的測定和分析，可以了解該鮮類植物的形態可塑性，結合生境指標，能夠了解環境條件對側葫類配子體形態的影響，或者一借助十形態上的變化，了解環境的變化情況.因此，根系分析儀在側葫類植物的生理生態學研究上，具有應用潛力。