現如今常用的有三種方法：B超檢查、IVU檢查、膀胱鏡檢查，其中B超檢查是初診和篩選的首選方法，可以準確觀察到輸尿管囊腫在膀胱內的確切位置、大小和形態，于膀胱三角區的側方可以看見典型的圓形含液性光環，隨輸尿管蠕動呈明顯的周期性增大和縮小。IVU檢查是最基本的檢查方法，可以觀察到腎臟、輸尿管、膀胱情況，了解泌尿系有無畸形、功能障礙，輸尿管囊腫內充盈造影劑時呈典型的“眼鏡蛇”樣特征性表現，排尿期膀胱造影更是觀察有無輸尿管返流的主要方法。膀胱鏡檢查可以直接觀察到膀胱內情況，但是由于個別輸尿管囊腫可以隨膀胱內壓增加而變小，甚至可以完全消失，所以，在用膀胱鏡觀察時一定要注意進水的多少，避免膀胱內壓力過高而致囊腫消失，造成漏診。
