根系與地上部生長發育的關系：
一方面垂直根如早期搶先發育導致地上部徒長延遲開花結果；反之，水平根發育良好，形成根網，有助于地上部較順利地向生殖生長轉化。
另一方面，地上部幼齡樹枝梢合成的營養物質(尤其是生長素類)首先滿足了垂直根的需要，促使其迅速向深土層推進，形成早期發育優勢，相對抑制了水平根系的發育，直至垂直根受深土層不良條件限制，加以地上部分枝級數遞增，樹冠迅速向四周擴展，水平根系相應逐步發育，進入生長高峰形成根網。當幼齡樹地上部代謝產物下行運輸受阻，或因各種原因地上部急劇衰退時，首先受害較重的是水平根系，然后才是垂直根。成年樹在地上部下行運輸受阻的情況下，受威脅較快而重的是垂直根系。
在發育早期，垂直根系自然分枝能力較低，即使在人為干預下(如切斷、培肥等)也改變不大，同時所發新根又多為生長根，較少萌發吸收根。水平根系則相反，表現有較強的分枝性，也較易誘發吸收根。發育后期，差別更為明顯。垂直根再發能力大大下降，水平根在人為干預下，只要地上部生長正常，是具有不斷分枝能力的。
水平根系以表土下30厘米為界，進一步劃分為面層根及深層根，這一劃分反映了柑桔根群對旱、澇、冷、熱季節的適應性。春季多雨季節，表土30厘米內土層為根系活躍層；高溫、秋冬旱、冷季節，根系活躍層則轉移至30厘米以下的深土層。
在指出垂直根與水平根本質區別的同時，還應看到其可塑性的一面。如幼齡樹生長前期，在大穴大壕溝深翻改土情況下，水平根系可向垂直根系方面轉化，反之，垂直根系在一定程度上(主要是根系的幼齡發育階段)也能逐步向水平根方面轉化。這種互相轉化在根群控制和培育上有很大利用價值，也為根群的培育措施提出了依據。
但是，必須指出，這一轉化在兩類根系上的表現是不一樣的。水平根有較大可塑性，垂直根則反之，甚至有較強的頑固性。然而垂直根的頑固性并不是不可改變的。曾將一些半年生橙樹的垂直根系挖出，自身成束打成一個大結，半年內雖然仍會萌發大量纖細的垂直根群向下繼續伸展，可是一年后已見水平根網迅速形成，一年半后則迅速增粗。此時打結后所發垂直根群已收縮不發育。從生理上來看，盡管垂直根并未直接轉化為水平根，但整個根群的生理特點已向水平根方面轉化。