1.診斷標準
目前，國際上常采用Lennard-Jones標準，國內采用1993年太原全國慢性非感染性腸道疾病學術研討會制定的《潰瘍性結腸炎的診斷標準及療效標準》，兩者均強調排除性診斷，內鏡及組織學特征。
（1）Lennard-Jones標準 有潰瘍性結腸炎臨床表現者，符合下列標準則提示本病的診斷。①首先必須排除下列疾病 感染性結腸炎、缺血性結腸炎、放射性結腸炎、孤立性結腸潰瘍、克羅恩病；②必須包括下列條件 活組織檢查顯示彌漫性的黏膜炎癥，無肉芽腫形成；內鏡或鋇劑灌腸檢查發現，炎癥累及直腸和部分或全結腸，病變從直腸開始，連續不斷地由遠端向近端逆行發展。
（2）全國慢性非感染性腸道疾病學術研討會標準 ①臨床表現 不僅有持續性或反復發作的黏液血便，腹痛，伴有不同程度的全身癥狀，而且不應忽視少數只有便秘而無血便的患者，既往史及體檢中要注意關節，眼，口腔，肝脾等腸外表現。②結腸鏡檢查 黏膜有多發性淺潰瘍，伴充血，水腫，病變大多從直腸開始，且呈彌漫性分布；黏膜粗糙呈細顆粒狀，黏膜血管模糊，質脆易出血，或附有膿性分泌物；可見假性息肉，結腸袋往往變鈍或消失。③黏膜活檢 組織學檢查呈炎癥性反應，同時常可見糜爛，潰瘍，隱窩膿腫，腺體排列異常，杯狀細胞減少及上皮變化。④鋇劑灌腸檢查 黏膜粗亂及（或）有細顆粒變化；多發性淺龕影或小的充盈缺損；腸管縮短，結腸袋消失可呈管狀。⑤手術切除或病理解剖 可見肉眼或組織學的潰瘍性結腸炎特點。
（3）排除相關疾病后診斷 在排除細菌性痢疾，阿米巴痢疾，慢性血吸蟲病，腸結核等感染性結腸炎及克羅恩病，缺血性結腸炎，放射性結腸炎的基礎上，可按下列標準診斷：①根據臨床表現，結腸鏡檢查中之一項和（或）黏膜活檢可以診斷本病。②根據臨床表現及鋇劑灌腸之一項可以診斷本病。③臨床表現不典型而有典型的結腸鏡檢查表現或鋇劑灌腸檢查典型改變者，可以診斷本病。④臨床表現有典型癥狀或典型既往史，而目前結腸鏡或鋇劑灌腸檢查并無典型改變者，應列為“疑診”隨訪。
2.主要臨床特點
最常見的癥狀為反復發作性結腸炎，急性發作時表現為血性腹瀉，發熱，腹痛，患兒表現有面色蒼白，貧血，營養不良，青春發育延遲，臨床上潰瘍性結腸炎應與細菌性痢疾，阿米巴腸炎，腸結核，局限性結腸炎（Crohns病），結腸腫瘤相鑒別。
3.主要輔助檢查
鋇灌腸及電子結腸鏡檢是有價值的診斷及鑒別診斷方法。