臨床表現因受累部位多少和器官不同差異大，年齡越小，受累器官越多病情越重。可呈局灶性或全身性變化，起病可急可緩，病程可短至數周或長達數年。多見以下表現：
1.皮疹
常見于1歲以下男嬰，皮疹既可與其他器官損害同時出現，也可以是惟一表現。皮疹較特殊，主要分布于軀干、頸部、頭皮和發際，四肢少見。初起為淡紅色斑丘疹，直徑1～3毫米，繼而呈出血性或濕疹樣、皮脂溢出樣皮疹，以后皮疹表面結痂、脫屑、脫痂后留有白斑或色素沉著。各期皮疹可同時存在，常成批發生，一批消退，一批又起，手觸摸時有粗糙感。出疹前常先發熱，出疹同時伴肝、脾增大，疹退熱降，肝、脾亦縮小。
2.骨病變
骨病變幾乎見于所有的LCH患者，單發病變常見，多表現為溶骨性損害，累及顱骨最常見，下肢骨、肋骨、骨盆和脊柱次之。眶骨病變可導致眼球突出或眼瞼下垂，下頜骨病變可出現牙槽腫脹和牙齒脫落。
3.肺
可單獨出現，也可作為全身病變的一部分。兒童期更常見，表現為不同程度的呼吸困難和缺氧，重者表現為氣胸、皮下氣腫或呼吸衰竭。
4.肝臟
常是全身病變的表現之一，表現為肝功能損害、黃疸、低蛋白血癥、腹水和凝血異常，重者肝纖維化和肝功能衰竭。
5.中樞神經系統
最常見的受累部位是丘腦-垂體后葉區，可以出現尿崩、生長障礙。彌散性LCH可有腦實質病變，常見表現有共濟失調、構音困難、視物模糊等。
6.耳和乳突
病變浸潤耳道軟組織或骨組織，表現類似外耳道炎，主要癥狀有外耳道溢膿、乳突炎、傳導性耳聾和慢性中耳炎。
既往根據臨床癥狀將本病分為三個類型即勒-雪綜合征、韓-薛-柯綜合征和骨嗜酸細胞肉芽腫。勒-雪綜合征多見于嬰幼兒，有發熱、皮疹，多臟器受累，病情進展快，預后不良。韓-薛-柯綜合征多表現為溶骨性骨破壞、突眼和尿崩癥。骨嗜酸細胞肉芽腫多見顱骨、四肢骨、脊椎、骨盆骨損害，病灶多為單發、亦可多發，預后良好。