神經肌肉阻斷劑：鹽酸伊立替康和神經肌肉阻斷劑之間的相互作用不能被排除。因為鹽酸伊立替康有膽堿酯酶抑制劑的活性，有膽堿酯酶抑制活性的藥物可以延長氯琥珀膽堿的神經肌肉阻滯作用，并且可以對抗非去極化藥物的神經肌肉阻滯作用。
抗腫瘤藥物：本品的不良反應，如骨髓抑制和腹瀉可以被其它有相似不良反應的抗腫瘤藥物加重。
抗驚厥劑：合并使用CYP3A 誘導的抗驚厥劑（如卡馬西平、苯巴比妥或苯妥英）會引起SN－38 暴露減少。對于需要抗驚厥劑治療的患者，應該考慮在初次使用鹽酸伊立替康治療之前至少一周開始或換用非酶誘導的抗驚厥劑。
酮康唑：同時接受酮康唑治療會引起鹽酸伊立替康的清除率顯著下降，導致其活性代謝產物SN－38 暴露增加。在開始鹽酸伊立替康治療前至少一周應停止使用酮康唑，當然它也不能與鹽酸伊立替康一同給藥。
St. John’s Wort（貫葉連翹）：在同時接受貫葉連翹治療的患者，活性代謝產物SN-38的暴露減少。在初次使用鹽酸伊立替康前至少一周停用貫葉連翹，該藥也不能與鹽酸伊立替康同時使用。
阿扎那韋：同時使用阿扎那韋，一種CYP3A4 和UGT1A1 的抑制劑，可能使SN-38 暴露增加。醫師在同時使用這些藥物的時候要考慮到這一點。
地塞米松：接受鹽酸伊立替康治療的患者有淋巴細胞減少的報道，地塞米松作為止吐藥使用時可能會使這種情況加重。然而，并沒有發現嚴重的機會性感染，也沒有發現因為淋巴細胞減少癥而導致的任何并發癥。
接受本品的患者有血糖增高的報道。通常這種情況發生在本品治療之前就有糖尿病病史或有葡萄糖耐量下降的患者。部分患者的血糖增高有可能是因為接受地塞米松而引起的。
丙氯拉嗪：在單藥每周給藥方案的臨床研究中，在鹽酸伊立替康治療當天同時給予丙氯拉嗪的患者，其靜坐不能的發生率比較高（8.5%, 4/47 患者)，當這兩種藥不是同天給予時其發生率比較低（1.3%, 1/80 患者)。然而，8.5%的靜坐不能的發生率仍在丙氯拉嗪作為用其他藥物化療前用藥出現靜坐不能的報道范圍之內。
緩瀉劑：本品治療的同時使用緩瀉劑有可能會加重腹瀉的嚴重程度或發生率，但是尚未進行這方面的研究。
利尿劑：由于在嘔吐和/或腹瀉后有繼發脫水的潛在風險，醫師應該避免在鹽酸伊立替康治療時使用利尿劑，當然在腹瀉或嘔吐時也不能使用利尿劑。