半衰期：分析藥物間在藥效動力學和藥代動力學上的相互作用時（例如從氟西汀換用其它抗抑郁藥時）應考慮氟西汀和去甲氟西汀較長的消除半衰期（詳見【藥代動力學】）。
單胺氧化酶抑制劑：（參見【禁忌】）。
配伍禁忌：MAOI-A（參見【禁忌】）。
合用時注意事項：
MAOI-B（司來吉蘭）：5-羥色胺綜合征風險，建議臨床監查。
苯妥英納：當與氟西汀合用時已發現血藥濃度存在變化。在一些病例中已有毒性反應報道。如果需要合用此藥物，建議采用保守的劑量調整策略并監查臨床狀態。
5-羥色胺激動劑：本品與5-羥色胺激動劑（如曲馬多、曲坦類）合用，可能增加5-羥色胺綜合征的風險。合用曲坦類時增加冠狀動脈痙攣和高血壓發生的危險性。
鋰鹽和色氨酸：有報告指出，鋰鹽和色氨酸與SSRIs合用時，可出現5-羥色胺綜合征。當本品與這些藥物合用時應十分小心。當氟西汀與鋰鹽合用時，需要更加細致和頻繁的監查。
CYP2D6酶：與三環類抗抑郁藥及其它選擇性5-羥色胺類抗抑郁藥類似，氟西汀經肝細胞色素CYP2D6同功酶系統代謝，因此，同樣經該酶系統代謝的藥物可能導致藥物相互作用。若合用其他主要經由此同功酶代謝的藥物且治療窗很窄（例如氟卡胺、恩卡胺、卡馬西平及三環類抗抑郁藥），其起始劑量應降低或將治療劑量調至治療范圍下限。如果最近5周內曾服用氟西汀，該原則同樣適用。
口服抗凝劑：偶見報告，氟西汀與口服抗凝劑合用時，抗凝作用發生變化（試驗數據和/或臨床癥狀體征），類型不一，但都包括增加出血癥狀。正在服用華法令的患者在起始或停止氟西汀治療時應接受仔細的凝血狀況監測（詳見【注意事項】：出血）。
電抽搐治療（ECT）：服用氟西汀的患者接受電抽搐治療時驚厥時間延長的情況鮮有報道，但也須謹慎。
乙醇：正規試驗中，本品不提高血中乙醇水平或增強乙醇作用。然而，不推薦SSRI治療與乙醇合用。
圣·約翰草：同其它SSRIs一樣，本品和草藥圣·約翰草（金絲桃素）可能發生藥效學相互作用，可能會增加5-羥色胺能效應，如5-羥色胺綜合征。
對駕車和機械操作的影響：盡管未發現氟西汀會影響健康志愿者的精神運動行為，但任何中樞神經作用藥物都可能影響人的判斷能力及技能。因此應告誡患者避免駕車或操作危險性的機械，直至患者相當確信他們的行為不受影響。