（1）肥胖癥與心血管系統肥胖癥患者并發冠心病、高血壓的幾率明顯高于非肥胖者，其發生率一般5～10倍于非肥胖者，尤其腰圍粗（男性>90cm，女性>85cm）的中心型肥胖患者。肥胖可致心臟肥大，后壁和室間隔增厚，心臟肥厚同時伴血容量、細胞內和細胞間液增加，心室舒張末壓、肺動脈壓和肺毛細血管楔壓均增高，部分肥胖者存在左室功能受損和肥胖性心肌病變。肥胖患者猝死發生率明顯升高，可能與心肌的肥厚、心臟傳導系統的脂肪浸潤造成的心律失常及心臟缺血有關。高血壓在肥胖患者中非常常見，也是加重心、腎病變的主要危險因素，體重減輕后血壓會有所恢復。
（2）肥胖癥的呼吸功能改變肥胖患者肺活量降低且肺的順應性下降，可導致多種肺功能異常，如肥胖性低通氣綜合征，臨床以嗜睡、肥胖、肺泡性低通氣為特征，常伴有阻塞性睡眠呼吸困難。嚴重者可致肺心綜合征，由于腹腔和胸壁脂肪組織堆積增厚，膈肌升高而降低肺活量，肺通氣不良，引起活動后呼吸困難，嚴重者可導致低氧、發紺、高碳酸血癥，甚至出現肺動脈高壓導致心力衰竭，此種心衰往往對強心劑、利尿劑反應差。此外，重度肥胖者尚可引起睡眠窒息，偶見猝死。
（3）肥胖癥的糖、脂代謝進食過多的熱量促進甘油三酯的合成和分解代謝，肥胖癥的脂代謝表現得更加活躍，相對糖代謝受到抑制，這種代謝改變參與胰島素抵抗的形成。肥胖癥脂代謝活躍的同時多伴有代謝的紊亂，會出現高甘油三酯血癥、高膽固醇血癥和低高密度脂蛋白膽固醇血癥等。糖代謝紊亂表現為糖耐量的異常和糖尿病，尤其是中心性肥胖者。體重超過正常范圍20%者，糖尿病的發生率增加1倍以上。當BMI>35kg/m時，死亡率約為正常體重的8倍。
（4）肥胖與肌肉骨骼病變①關節炎：最常見的是骨關節炎，由于長期負重造成，使關節軟骨面結構發生改變，膝關節的病變最多見。②痛風：肥胖患者中大約有10%合并有高尿酸血癥，容易發生痛風。③骨質疏松：以往的觀點認為肥胖者骨質疏松并不多見，但近年來的研究發現，肥胖者脂肪細胞分泌多種脂肪因子和炎性因子，可能會加重肥胖者骨質疏松和骨折的發生。
（5）肥胖的內分泌系統改變①生長激素：肥胖者生長激素釋放是降低的，特別是對刺激生長激素釋放因子不敏感。②垂體-腎上腺軸：肥胖者腎上腺皮質激素分泌是增加的，分泌節律正常，但峰值增高，促腎上腺皮質激素（ACTH）濃度也有輕微的增加。③下丘腦-垂體-性腺軸：肥胖者多伴有性腺功能減退，垂體促性腺激素減少，睪酮對促性腺激素的反應降低。男性肥胖者，其血總睪酮（T）水平降低，但輕中度肥胖者，游離睪酮（FT）尚正常，可能是由于性激素結合球蛋白（SHBG）減少所致。而重度肥胖者FT也可下降。另外，脂肪組織可以促進雄激素向雌激素的轉化，所以肥胖男性部分會出現乳腺發育，肥胖女孩，月經初潮提前。成年女性肥胖者常有月經紊亂，無排卵性月經，甚至閉經，多囊卵巢綜合征發生率高。④下丘腦-垂體-甲狀腺軸：肥胖者甲狀腺對促甲狀腺激素（TSH）的反應性降低，垂體對促甲狀腺素釋放激素（TRH）的反應性也降低。