體內和體外試驗評價了恩替卡韋的代謝情況。恩替卡韋不是細胞色素P450( CYP450)酶系統的底物、抑制劑或誘導劑。在濃度達到人體內濃度約10000倍時，恩替卡韋不抑制任何主要的人CYP450酶： 1A2、2C9、2C19、2D6、3A4、286和2E1。在濃度達到人體內濃度約340倍時，思替卡韋不誘導人CYP450酶： 1A2、2C9、2C19、3A4、3A5和2B6。同時服用通過抑制或誘導CYP450系統而代謝的藥物對恩替卡韋的藥代動力學沒有影響。而且，同肘服用恩替卡韋對已知的CYP底物的藥代動力學也沒有影響。
研究馬來酸恩替卡韋片與拉米夫定、阿德福韋和替諾福韋的相互作用時，發現馬來酸恩替卡韋片和與其相互作用藥物的穩態藥代動力學均沒有改變。
由于馬來酸恩替卡韋片主要通過腎臟清除，服用降低腎功能或競爭性通過主動腎小球分泌的藥物的同時，服用恩營卡韋可能增加這兩個藥物的血藥濃度。同時服用恩替卡韋與拉米夫定、阿德福
韋、替諾福韋不會引起明顯的藥物相互作用。同時服用恩替卡韋與其他通過腎臟清除或已知影響腎功能的藥物的相互作用尚未研究。患者在同時服用恩替卡韋與此類藥物時要密切監測不良反應的發生。