鮑曼不動桿菌感染的治療一直是臨床上很大的難題，因為鮑曼不動桿菌極易對各種消毒劑和抗菌藥物產生耐藥性，對重癥患者、ICU病房的患者等威脅很大。MDR-AB（多重耐藥鮑曼不動桿菌）、PDR-AB（泛耐藥鮑曼不動桿菌）、CRAB（耐碳青霉烯類鮑曼不動桿菌）等的廣泛傳播更是成了醫生和患者的噩夢。
在院內感染中，不動桿菌屬的感染占有較高的比例，而在院內提取到的不動桿菌屬的菌株，絕大多數為鮑曼不動桿菌。鮑曼不動桿菌為革蘭氏陰性菌，故對萬古霉素等存在固有耐藥，對青霉素G、氨芐西林、阿莫西林、氯霉素、四環素、第一及第二代頭孢菌素也保持著較高的耐藥率。通常情況下，對鮑曼不動桿菌有較強作用的藥物主要有抗綠膿桿菌的青霉素類、第三和第四代頭孢菌素（主要是頭孢他啶、頭孢吡肟等）、碳青霉烯類、β-內酰胺類抗生素復合制劑（頭孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林/他唑巴坦等）、氟喹諾酮類、氨基糖苷類、替加環素、多粘菌素、舒巴坦等。但是因為近年來抗菌藥物的濫用，鮑曼不動桿菌對以上藥物的耐藥率也在不斷上升，氟喹諾酮類、氨基糖苷類等耐藥率甚高，碳青霉烯類的耐藥率也有上升。
考慮到鮑曼不動桿菌極易對抗菌藥物耐藥，故用藥時應聯合用藥。常用的方案有β-內酰胺類+氟喹諾酮類、β-內酰胺類+氨基糖苷類等。我個人首選的方案為頭孢哌酮/舒巴坦+磷霉素（時間差攻擊療法），也可選擇氨芐西林/舒巴坦+環丙沙星等）。