增加柱長可提高分離效果。但柱長過長，使分析時間延長。所以在滿足一定分離度的條件下，應選用盡可能短的色譜柱。填充柱的柱內徑一般為 3?6 mm，毛細管柱的內徑0.1?0.5 mm。
固定液的用量選擇：擔體的表面積較大時，固定液用量可多些，允許的進樣量也相應增加。但從速率方程式的傳質項中可知，為了減小液相的傳質阻力，應使固定液的液膜厚度盡可能薄。但固定液液膜太薄，則允許的進樣量也就越少。因此固定液的用量要根據具體情況決定。
固定液的配比選擇：(指固定液與擔體的質量比)一般為5?100到25?100。擔體的比表面積越大，固定液用量的比例可越高。
擔體的性質和粒度選擇：若擔體的比表面積大，孔徑分布均勻，則固定液易分布均勻，從而可加快傳質過程，提高柱效。故應該選用顆粒小且均勻的擔體，并盡可能填充均勻，以減少渦流擴散，提高柱效。但粒度過小，填充不易均勻，會使柱壓降增大，對操作不利。一般對4?6 mm的柱管，選用60 ?80目或80 ?100目的擔體較為合適。
常用色譜柱為：
SE-30、OV-1、OV-101 二甲基硅氧烷 非極性 DB-l、HP-1、CP-Sil5CB、SPB-1、 007-1、 Rtx-1、BP-1... ... 烴類、胺類、酚類、農藥、PCBs、揮發油、硫化物等
SE-54、SE-52 5%苯基，1%乙烯基甲基硅氧烷 非極性 DB-5、HP-5、CPSil 8CB、SPB-5、、Rtx-5、BP-5... ... 藥物、芳烴類、酚、酯、生物堿、鹵代烴
OV-1701 7%氰甲基，7%苯基甲基硅氧烷 中等極性 DB-1701、HP-1701、BP-10、CPSil 19CB 、 Rtx-1701、SPB-1701... ... 藥物、農藥、除草劑、TMS、糖
OV-17 50%苯基甲基硅氧烷 中等極 DB-17、 HP-50、SP2250、CP-Sil 19、Rtx-50 、SPB-50... ... 藥物、農藥、甾類等
PEG-20M 聚乙二醇20M 極性 DB-WAX、HP-Wax、Carbowax SUPELCOWAX10、CPWAX 52CB... ... 醇類、酯、醛類、溶劑、單芳、精油等
FFAP 聚乙二醇20M對苯二甲酸的反應產物 極性 DB-FFAPHP-FFAP Nuk01、SP-1000... ... 醇、酸、酯、醛、腈
XE-60、 25%氰乙基甲基硅氧烷 中極性 酯、硝基化合物
OV-225 25%氰乙基，25%苯基甲基硅氧烷 中極性 DB，225、HP-225、SP-2330、SPB-225、 CP-SIL43CB 脂肪酸酯、PUFA、Aldito]
OV-210 50%三氟丙基硅氧烷 極性 DB210、Rtx200... ... 極性化合物、有機氯化合物
OV-275 50%三氟丙基硅氧烷 強極性 DB210 、SP2401 、Rtx200... ... 極性化合物、
一、固定液
非極性：SE30*，OV101，SE54*
中極性：OV17，XE60*，OV1701*
極 性：PEG20M*，FFAP*，DEGS*
二、柱內經(mm)
0.2~0.25柱效高、負荷量低、流失小
0.3~0.35負荷量大于毛細口徑柱60%，柱效低
0.53~0.6大口徑毛細柱，負荷量近似填充柱，總柱效遠遠超過填充柱，分析速度快
三、柱長(m)
短柱10~15米 分離少于10個組份的樣品
中長柱20~30米 分離10~15個組份的樣品
長柱50米以上分離50個組份以上的樣品
四、液膜厚度(μm)
薄液膜0.1~0.2μm 低負荷量、高沸點化合物
標準液膜0.25~0.33μm 一般標準毛細柱分析
厚液膜0.5~1μm 符合量較大，低沸點樣品
特厚液膜1~5μm 取代填充柱，分析沸點200℃以下復雜樣品