水相法分離染色質
試劑、試劑盒:水相裂解緩沖液
儀器、耗材:離心機
實驗步驟:
像聚胺法的第 1、2 步中講的那樣誘導懸浮或單層培養細胞的中期阻遏狀態。
2. 細胞在 4℃,1000 g 離心 10 分鐘然后重懸浮,典型的制備量為 10 ml 新鮮培養基含 108 個細胞。
3. 將濃的細胞懸液在冰上放置至少 30 分鐘冷卻以幫助有絲分裂復合物的完全解離。
4. 4℃ 1000 r/min 離心 10 分鐘沉淀細胞。
5. 沉淀用 10 ml 75 mmol/L 的 KCI 重懸浮,4℃ 孵育 20 分鐘進行低滲溶脹。
6. 4℃ 1000 r/min 離心溶脹細胞。
7. 將細胞重懸浮于 10 ml 的水相裂解緩沖液中,溫和攬拌,冰上放置 5 分鐘。
水相裂解緩沖液:
10 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.4)
120 mmol/L KCl
20 mmol/L NaCl
0.1 % Triton X-100
含 2 mmol/L CaCl2 的 0.1 mmol/L PMSF
8. 將懸液溫和地反復通過一 25 號皮下注射針頭大約 10 次或用 Dounce 勻漿器破碎法使細胞完全裂解(避免產生氣泡)。
9. 將破碎的細胞在 4℃ 400 g 離心 3 分鐘去除細胞核,上清移至一干凈的離心管中。
10. 4℃ 3000 g 離心上清 15 分鐘以濃縮染色體。