MC所致許多感染均可口服抗生素治療。MC對以下藥物通常是敏感的：阿莫西林-克拉維酸、磺胺甲噁唑/甲氧芐啶（復方磺胺甲噁唑）、四環素、第二代口服頭孢菌素、大環內酯類、氟喹諾酮類等。MC也對替卡西林、哌拉西林、注射用頭孢菌素、氨基糖苷類抗生素敏感。對青霉素、氨芐西林、萬古霉素、克林霉素和林可霉素耐藥。
因此對MC菌感染者，建議首選阿莫西林-克拉維酸和（或）氨基糖苷類抗生素。此外，對于原發病的治療，增強抵抗力加強營養支持療法等亦十分重要。
