一.急性甲亢性肌病
急性甲亢肌病治療較困難，治療可參照甲亢危象處理。需進行監護搶救，必要時行氣管切開術，應用呼吸機輔助呼吸，但多數患者在1-2周內死亡。
二.慢性甲亢性肌病
慢性甲亢性肌病應用新斯的明類藥一般無效。慢性甲亢性肌病的嚴重程度大多數與甲亢的嚴重程度呈平行關系，甲亢控制后，肌病即好轉或恢復，一般不需要特殊處理，因此，本病的治療應以控制甲亢為主。有甲亢引起的慢性肌病的肌肉萎縮和肌電圖的異常改變，在甲亢病情好轉，血中甲狀腺激素水平恢復正常以后，都能完全消失。
三.甲亢性周期麻痹
1、一般護理及預防；
（1）避免進高糖飲食。
（2）避免飽食。
（3）睡前不宜進食，
（4）避免寒冷、劇烈運動、情緒激動及感染。
（5）血清鉀經常低于3.5mmol/L以下者，應用抗甲狀腺藥物治療甲亢的同時，要酌情適量服用鉀鹽預防。
2、治療；甲亢性周期麻痹治療的最根本措施仍是針對原發病的治療。長期抗甲狀腺藥物治療，甲狀腺次全切手術或放射性131I治療對該病均適用。甲亢被有效控制后，周期麻痹一般不再發作，如甲亢復發，周期麻痹會隨之再出現。甲亢周期麻痹發作時，應立即補鉀；一般可口服氯化鉀3g，每6-8h1次；發作嚴重者可用氯化鉀1.5g加入生理鹽水500ml內靜滴，有時可用到3-5g/d，以每小時不超過1g為宜。病情穩定后改用口服鉀鹽。通常1-5h后肢體的活動恢復。對同時伴低鎂血癥者，應補充鎂劑，以激活細胞膜上的“鈉泵”，以利于細胞內外鉀鈉平衡，使病情得以控制。在甲亢的治療過程中，心得安20-40mg，每6h1次口服，能減輕或防止甲亢性周期麻痹的發作，但此時測患者血鉀仍低，提示甲亢性周期麻痹和β受體有關，且心得安的作用是在低血鉀的環節之后。
四.甲亢性眼肌麻痹
治療上與甲亢性突眼相同。
五.甲亢伴重癥肌無力
治療時應在積極控制甲亢的原則下，針對甲亢和肌無力分別用藥。一般認為，治療甲狀腺功能亢進癥對重癥肌無力幫助不大，而新斯的明、呑錫龍等乙酰膽堿酯酶抑制劑治療肌無力效果良好，輕癥者選用新斯的明每日5-15mg，或吡啶斯的明每日60-120mg，酶抑寧每日10-20mg，分次口服。重癥者可用酶抑寧每日30-50mg，吡啶斯的明180-300mg，分次口服，或新斯的明0.5-1mg肌內注射，每4-6h1次。對嚴重的全身型、延髓型重癥肌無力患者，抗膽堿酯酶藥物治療效果不佳或無效者，可使用糖皮質激素類藥物，如促腎上腺皮質激素每日100U，肌注或靜滴；強的松30-140mg口服，每日或隔日1次，癥狀好轉后逐漸減量至停藥。但應用糖皮質激素可使重癥肌無力癥狀一過性加重，嚴重者誘發肌無力危象，因此應在做好氣管切開和人工呼吸的準備下給予治療。對病程較長，肌無力嚴重、藥物療效不佳者，可考慮胸腺放射治療或胸腺切除，但療效不一，各家報道差異較大。