海藻糖酶是一種胞外酶，位于哺乳動物腎和小腸上皮細胞膜的刷狀緣，國際酶學編號為EC3.2.1.28，屬于水解酶類，它能催化水解一分子海藻糖生成兩分子葡萄糖，且底物作用是高度專一的。海藻糖酶的等電點為4.37，在正常體液pH7.4時帶有大量負電荷。該酶已從哺乳動物，腎臟中提純，經SDS-PAGE電泳顯示出一個75kDa的分子帶。
海藻糖酶的cDNA已從家兔、人、和鼠組織中分離出來。人海藻糖酶cDNA完整序列顯示，該酶由583個氨基酸殘基組成，在氨基端含有一個由19個氨基酸殘基組成的典型的可切信號肽，在羧基端含有5個潛在的糖基化位點和—個疏水區。
尿海藻糖酶通過糖基化磷脂酰肌醇連接于腎小管上皮細胞膜刷狀緣，需特異的磷脂酶C水解才能將其完全從上皮細胞膜釋放出來。