最好不要。溶劑最好是使用流動相。因為純乙腈，純甲醇和流動相之間會有差異存在。第一是溶解度的問題，很多樣品在有機溶劑中溶解度很好，在水相中溶解度稍差。這樣的樣品在用甲醇、乙腈配制時溶解非常好，但是到流動相中可能會析出，從而堵住進樣口。第二就是極性和酸堿度差異問題。如果流動相中水相比例很高，或者酸堿度偏差很大，那么樣品很可能會出現肩峰或者叉峰的情況。有的樣品可以用純水作為溶劑，但是一般的實驗都盡量避免用純乙腈或者甲醇作為溶劑。
