液相色譜儀所用流動相必須預先脫氣，否則容易在系統內逸出氣泡，影響泵工作、柱分離效率、檢測器靈敏度和基線穩定性，甚至無法檢測。
一、流動相中的溶解氧可能與樣品、流動相甚至固定相（如烷基胺）反應。
二、溶解氧會引起溶劑pH變化，給分析結果帶來誤差。
三、溶解氧能與某些溶劑（如甲醇和四氫呋喃）形成有紫外吸收的絡合物，此絡合物會提高背景吸收（特別是在260nm以下），導致檢測靈敏度輕微降低，更重要的是在梯度洗脫時會造成基線漂移或形成鬼峰。除去溶解氧將大大提高UVD的性能。
四、在熒光檢測中，溶解氧在一定條件下會引起淬滅現象，特別是對芳香烴、脂肪醛和酮等。在某些情況下，熒光響應可降低達95%。除去溶解氧將改善在一些熒光檢測中的靈敏度。
五、在電化學檢測中（特別是還原電化學法），溶解氧的影響更大。
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