（1）由于甲醇廉價，對于反相柱推薦使用甲醇體系(必須使用乙腈的場合除外)。
（2）對于正相柱推薦使用沸程為30-60 ℃的石油醚或提純后的己烷作流動相，沒有提純的己烷不得使用。用水最好使用超純水(電阻率大于18兆歐)，去離子水及雙蒸水中含有酚類雜質，有可能影響分析結果。
（3）含水流動相最好在實驗前配制，尤其是夏天使用緩沖溶液作為流動相不要過夜。最好加入疊氮化鈉，防止細菌生長。
（4）流動相要求使用0.45μm濾膜過濾，除去微粒雜質。
（5）使用HPLC級溶劑配制流動相，使用合適的流動相可延長色譜柱的使用壽命，提高柱性能。