阿米巴病呈世界性分布，全球高發地區位于墨西哥、南美洲東部、東南亞，西非等，地處北緯10°至南緯10°之間的熱帶和亞熱帶地區，平均感染率在20％以上，個別地區如埃及可達57％～87％。
據報告，我國近年的人群感染率在0.7％～2.17％之間，大多見于經濟條件、衛生狀況、生活環境較差的地區，農村高于城市。人群的感染主要通過人際經口傳染，主要傳播環節是被含有包囊的糞便污染的水源。
居民點的水源被污染常釀成該地區的爆發流行和異乎尋常的高感染率；其次是手指、食物或用具的被污染；衛生習慣不良的帶蟲者是危險的傳染源，蠅及蟑螂等昆蟲也能對包囊起一定的傳播作用。
由于缺乏有效的獲得性免疫，患過阿米巴病的人仍是易感者。易感性與性別，年齡無相關性，流行統計中的男性高發現象，多與生活習慣和職業等因素有關。