滅活疫苗是指先對病毒或細菌進行培養，然后用加熱或化學劑（通常是β-丙內酯或福爾馬林）將其滅活。滅活疫苗即可由整個病毒或細菌組成，也可由它們的裂解片段組成為裂解疫苗。裂解疫苗的生產，是將微生物進一步純化，直至疫苗僅僅包含所需的抗原成分（如肺炎球菌多糖）。它既可以是蛋白質疫苗，也可以是多糖疫苗。蛋白質疫苗包括類毒素（滅活細菌毒素）和亞單位疫苗。大多數多糖疫苗由來自細菌純化的細胞壁多聚糖組成；結合疫苗是將多糖用化學方法與蛋白質連接而得到的疫苗，從而成為更有效的疫苗。
