1．血液檢查：
（1）血常規：貧血、急性期白細胞升高。
（2）便常規：可見紅、白細胞，潛血陽性。
（3）血沉增快，C-反應蛋白升高，血漿球蛋白升高，類風濕因子陰性，抗核抗體陰性。
（4）潰瘍性結腸炎患者有半數以上出現抗中性粒細胞胞漿抗體(ANCA)，常為核周型ANCA。
（5）伴強直性脊柱炎患者出現HLA-B27陽性占50%～70%。潰瘍性結腸炎脊柱炎患者的HLA-Bw62頻率明顯增高。
2．滑液檢查：細胞數多為(5～7)×10/L，以中性粒細胞為主，滑液細菌培養為陰性。
3．放射學檢查：
（1）關節：可見軟組織腫脹、近關節面輕度骨質疏松，偶有骨膜反應和骨侵蝕。骶髂關節炎表現同強直性脊柱炎。
（2）鋇餐檢測：炎癥性腸病患者行鋇餐檢查的表現為：黏膜粗亂或顆粒樣改變；腸管短縮，袋囊消失呈鉛管樣；腸管邊緣呈現毛刺樣或鋸齒狀，腸壁有多發性小充盈缺損。
4．CT檢查：分辨力高，可以排除骶髂關節結構復雜和盆腔內結構的干擾．有利于發現骶髂關節輕微的病變，適于早期診斷。炎癥腸病性關節炎的脊柱受累者多呈節段性融合，非對稱性，常見邊緣骨橋形成。
5．磁共振成像(MRI)檢查：對軟組織病變(尤其是軟骨)的分辨力更高，所以能比CT更早發現骶髂關節炎及關節周圍軟組織腫脹、硬化和脂肪沉積。骶髂關節周圍軟組織腫脹信號，不僅是診斷骶髂關節炎的重要征象，且可作為判斷病變是否活動期的影像學指標。
6．結腸鏡檢查：炎癥腸病性關節炎患者的腸道病變多發生于直腸部位，且呈現出連續性、彌漫性分布。具體表現為：
（1）黏膜血管紋理模糊和紊亂，腸粘膜消失、水腫、充血、出血、易脆及伴膿性分泌物附著，并常見黏膜粗糙，呈細顆粒狀；
（2）緩解期患者可見結腸袋囊變淺、變鈍甚至消失，或出現假息肉及橋型黏膜等；
（3）明顯病變處可見彌漫性多發性潰瘍或糜爛。
7．小腸鏡：可同時取活檢做病理，以早期診斷。