一直以來,牛津納米孔公司對其核心產品的微通道都持有保密態度,然而自測序巨頭Illumina公司對其進行ZL訴訟之后,牛津納米孔透露了其最新設備的驅動因子——細菌孔隙,似乎有意回避Illumina的ZL之戰。
納米孔測序被譽為是一個比傳統測序更便攜和實惠的技術,根據單核苷酸通過孔隙產生的電流變化來檢測DNA的序列,2014年,牛津納米孔推出了第一款商業化的納米孔測序儀——MinION。雖然研究人員稱贊該技術并為提高其準確性而不斷努力,但對MinION的孔隙結構一無所知。
2月23日,Illumina公司起訴牛津納米孔公司使用細菌驅動孔隙——恥垢分枝桿菌孔蛋白A(Mycobacterium smegmatis porinA,MspA)侵犯了Illumina的ZL。對那些擔心失去納米產品或擔心ZL之戰會扼殺新平臺發展的研究人員而言,本次訴訟是一個非常痛心的消息。巴爾地摩約翰霍普金斯大學的生物醫學工程師 Winston Timp說,“相比宣布一場訴訟而言,我更希望Illumina發布一個新的測序平臺”。
當地時間3月8日,牛津納米孔公司為客戶組織的網絡直播演講可能使不少人卸下心中的擔憂。在此次網絡直播演講中,牛津納米孔公司首席技術官 Clive Brown宣布了公司設備的升級——R9。Brown表示,R9實際上是CsgG,是來源于大腸桿菌的蛋白膜,也存在于多種細菌中,在核苷酸通過孔隙時這種蛋白應該比更新前的版本R7有更好的識別力。初步結果表明R7系統的精確度在75%到90%之間,取決于DNA通過孔隙時如何被讀取,而新系統(R9)精確度在85%-95%之間。然而,Brown并沒有透露關于R7的身份,但他表示公司將在今年春天將所有客戶的系統更新至R9,一款只包含R9的更強大的測序儀—— PromethION將于三月底發布。
比利時弗蘭德斯生物技術研究所分子生物學家Han Remaut引領的研究團隊已于2014年發布了CsgG的結構,牛津納米孔技術公司對該孔隙持有獨家ZL,Brown說,“對我們而言,這就是前進的方向。”
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