與固有免疫相比，特異性免疫應答有三個主要特點：
1.特異性：特異性是指某一特定抗原刺激可以從免疫系統淋巴細胞庫中選擇出相應的T細胞或B細胞克隆，淋巴細胞與相應抗原的結合具有高度的特異性；多樣性是指T細胞庫或B細胞庫呈高度的異質性，是許許多多特異性識別抗原細胞克隆的總和，賦予機體具有識別周圍環境中數量極大的抗原種類并與之發生反應的能力。
2.耐受性：在胚胎期，自身組織成分與相應的淋巴細胞克隆相遇，這些淋巴細胞克隆被刪除或被禁忌，出生后這些克隆喪失了針對自身組織成分的反應性，即免疫耐受，但完好地保留了針對“非己”抗原的識別和反應能力。免疫耐受機制是免疫系統區別自身和非己的關鍵。
3.記憶性：T細胞和B細胞在初次免疫應答過程中都會產生由經抗原刺激活化、增殖淋巴細胞分化而來的記憶細胞，這種記憶細胞與初始（或未致敏）淋巴細胞不同，當再次遇到相同抗原時，可出現應答的潛伏期短、強度大、持續時間長的再次免疫應答。