玉米赤霉烯酮具有雌激素的作用，其強度為雌激素的十分之一，可造成家禽和家畜的雌激素水平提高。目前發現，豬對此毒素較為敏感。玉米赤霉烯酮作用的靶器官主要是雌性動物的生殖系統，同時對雄性動物也有一定的影響。在急性中毒的條件下，對神經系統、心臟、腎臟、肝和肺都會有一定的毒害作用。主要的機理是它會造成神經系統的亢奮，在臟器當中造成很多出血點，使動物突然死亡。主要的原因還是由于雌激素水平過高而造成的。
